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天天热推荐:Linux与生物信息
2023-02-22 19:16:57
来源:哔哩哔哩

常见的操作系统


(资料图片仅供参考)

Linux属于一种计算机操作系统,与 windows 系统和苹果的 macos 类似,此外手机中的Android系统也是基于 linux系统衍而来的。

Linux 相比于 windows 和 macos 具有很多显著的优势。 

第一、开源免费; 

第二,稳定并且效率更高; 

第三,支持多任务多用户; 

第四,安全性高;

但是,由于Linux相比于windows系统和macos系统人性化差学习门槛高软件生态较差。目前在个人计算操作机系统市场中只占 3%左右。

Linux发行版本//

不同发行版本就像Window系统中的win7、win8、win10、win11一样。

常见的Linux两大阵营 RedhatDebian使用不同的软件安装工具,yumapt。选择不同Linux版本会对生物软件安装过程中环境问题有影响,环境问题也是学习生信中比较烦恼的。

那么选择什么版本的Linux系统呢?

UbuntuCentOS是 Linux 当中非常著名的两个发行版本。很多生物信息软件都会分别提供这两个系统版本。但由于大多数个人开发者使用ubuntu系统开发生物信息软件,因此,选择ubuntu系统更友好一些

不过后续多数软件使用bioconda来安装,二者之间的差别几乎可以忽略不计。

原因如下:

1. 使用的生物软件只有 Linux 命令行版本;

2. Linux 系统是开源免费的;

3. 高性能计算都采Linux系统;

4. Linux 系统本身具有很多优点,例如多用户多任务;

5. 命令行进行自动化和批量化操作。

取Linux学习环境

1.在自己电脑上安装Linux系统,形成双系统

2.在自己电脑上安装VBox虚拟机,虚拟一个Linux系统。

3.购买服务器

4.租用云服务器

5.购买国家超算服务器

明天分享如何获取Linux学习环境,带你踏入生信分析大门!

关键词: 生物信息 环境问题 操作系统

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